Zásady územního rozvoje po svém vydání nahradí územní plány velkých územních celků (dále jen „ÚPVÚC"), pořízené a schválené na území Jihočeského kraje, respektive nahradí tu jejich část, která zůstala podle § 187 odst. 7 SZ platná i po 1. 1. 2007. ZÚR jsou zpracovány pro celé území Jihočeského kraje. V ZÚR jsou zapracovány záměry uvedené v Politice územního rozvoje ČR 2008 a jsou zde podle § 187 odst. 2 SZ bez věcné změny převzaty i některé záměry ze schválených ÚP VÚC. Jejich cílem je v souladu se směrnicí „Evropská perspektiva územního rozvoje" a Programem rozvoje Jihočeského kraje vytvářet předpoklady pro vyvážený vztah územních podmínek pro příznivé životní prostředí, pro hospodářský rozvoj a pro soudržnost společenství obyvatel území, tzn. pro udržitelný rozvoj společnosti, tj. takový rozvoj, který současným i budoucím generacím zachovává možnost uspokojovat jejich základní životní potřeby a přitom nesnižuje rozmanitost přírody a zachovává přirozené funkce ekosystémů, dále pak pro posilování hospodářské a společenské soudržnosti kraje a zachování jeho přírodních hodnot a kulturního dědictví. Za tímto účelem ZÚR řeší záměry regionálního, nadregionálního, celostátního a mezinárodního významu. Jsou zde navrženy rozvojové oblasti, které svým významem a dopady mohou mít vliv na území celého kraje a je řešen rozvoj systémů dopravní a technické infrastruktury tak, aby jejich vzájemné uspořádání a vazby vytvářely podmínky pro rozvoj území, zlepšovaly kvalitu životního prostředí, zabezpečovaly soulad jednotlivých činností při minimalizaci jejich negativních vlivů, umožňovaly racionální využívání neobnovitelných přírodních zdrojů s ohledem na ochranu přírody a krajiny a přispívaly k zachování kvalitativních ukazatelů obnovitelných přírodních zdrojů.

Zastupitelstvo Jihočeského kraje schválilo svým usnesením ze dne 27. 11. 2001 č. 81/2001/ZK Program rozvoje územního obvodu Jihočeského kraje, jehož součástí byl i Akční plán obnovy a rozvoje Jihočeského kraje na rok 2003. V tomto dokumentu bylo v souladu s ustanovením § 17 odst. 2 zákona č. 50/1976 Sb., o územním plánování a stavebním řádu, v tehdy platném znění (dále jen „zákon 50/1976 Sb.), stanoveno v rámci strategických cílů a rozvojových aktivit i pořízení a vypracování Územního plánu velkého územního celku Jihočeského kraje.

Návrh zadání byl zpracován v souladu s ustanovením § 20 odst. 1 zákona č. 50/1976 Sb. a s vyhláškou MMR č. 135/2001 Sb., o územně plánovacích podkladech a územně plánovací dokumentaci, ve znění pozdějších předpisů, a byl projednán v souladu s ustanovením § 20 zákona č. 50/1976 Sb.. Zadání pro zpracování ÚPVÚC JČK bylo schváleno usnesením Zastupitelstva Jihočeského kraje č. 241/2004/ZK dne 14. září 2004. Stanovisko nadřízeného orgánu územního plánování, kterým bylo Ministerstvo pro místní rozvoj, odbor územně a stavebně správní, bylo vydáno dne 20. srpna 2004 pod č.j. 22000/2004 - 63/2134.

Koncept řešení byl zpracován na podkladě schváleného zadání. Vlastní dokumentace konceptu ÚP VÚC byla dokončena a odevzdána pořizovateli k projednání dne 29. 5. 2005, dokumentace SEA pak 21. 12. 2005. Ode dne 22. února 2006 začalo veřejné projednávání konceptu ÚPVÚC. Koncept řešení byl projednán s dotčenými orgány státní správy, ale nebyl s nimi ve všech bodech dohodnut. Konceptem však byly prověřeny a dohodnuty některé varianty řešení. Byl proto využit jako územně plánovací podklad pro zpracování ZÚR.

Vzhledem ke skutečnosti, že obsah schváleného zadání ÚPVÚC splňoval požadavky SZ na obsah ZÚR, bylo jej možno v souladu s ustanovením § 187 odst. 6 stavebního zákona považovat za schválené zadání ZÚR. Po formální stránce však požadované členění schváleného zadání neodpovídalo požadavkům současné legislativy na členění ZÚR. Stejně tak část problémů, které zadání ÚPVÚC požadovalo řešit, nespadala nadále svým rozsahem a významem do okruhu problémů, které měly být dle současně platné legislativy řešeny ZÚR a zároveň část problémů, u kterých bylo požadováno variantní řešení, byla prověřena v rámci zpracování konceptu ÚPVÚC a bylo proto možno od dalšího zpracování a prověřování variant buď zcela upustit nebo počet variantních řešení omezit. Vzhledem k výše uvedeným skutečnostem Krajský úřad Jihočeského kraje, jako pořizovatel ZÚR, zpracoval upřesňující pokyn k zadání ÚPVÚC. Tento pokyn byl projednán v zastupitelstvu kraje, ve výboru pro rozvoj kraje a v radě kraje a byl jimi vzat na vědomí (zastupitelstvem kraje dne 17. 4. 2007).

Je dokončen a převzat návrh zásad územního rozvoje kraje, včetně dokumentace „posouzení Zásad územního rozvoje Jihočeského kraje na životní prostředí podle přílohy stavebního zákona (dokumentace SEA)" a hodnocení koncepce "Zásady územního rozvoje Jihočeského kraje" na evropsky významné lokality a ptačí oblasti (NATURA 2000) a rozboru udržitelného rozvoje území.

Návrh ZUR byl přeložen do německého jazyka a byly nabídnuty konzultace sousedním státům prostřednictvím min. zahraničí a dále byl návrh ZUR představen i spolkovým zemím Dolní Bavorsko, Horní Rakousko a Dolní Rakousko na jednání dne 26. 2. 2009 v Nových Hradech. Prezentován byl i prostřednictvím pracovních skupin a KHEJ.

Dne 6. 8. 2008 proběhlo společné jednání s dotčenými orgány a sousedními kraji podle § 32 odst. 2 stavebního zákona. Současně bylo projednáno s příslušnými ministerstvy vyhodnocení vlivů na udržitelný rozvoj území dle § 37 odst. 4 stavebního zákona. Dne 6. 10. 2008 bylo krajskému úřadu doručeno poslední stanovisko dotčeného orgánu. Od tohoto data probíhala dohodovací jednání s dotčenými orgány dle § 4 odst. 2 stavebního zákona. Na podkladě uzavřených dohod s dotčenými orgány byl návrh ZUR upraven. V současné době zbývá dokončit pouze dohadovací jednání s Českým báňským úřadem. Projednat a dohodnout podle § 4 odst. 7 stavebního zákona se pořizovateli nepodařilo záměry lyžařského areálu Špičák ve VÚ Boletice, lyžařského areálu Smrčina, Šumavských elektrických drah, rozšíření komunikace na Zadní Zvonkovou, vymezení lokalit pro přirozenou akumulaci povrchových vod a způsobu vydání stanoviska MŽP k hodnocení vlivu ZÚR na životní prostředí a systém NATURA.Tyto výše uvedené rozpory byly dne 9. 4. 2009 předány k dalšímu řešení na Ministerstvo pro místní rozvoj. MMR se nepodařilo dohodnout záměry lyžařských areály Špičák a Smrčina, kde přetrvává negativní postoj MŽP. Ostatní záměry směřují dohodám. Rozpory u záměrů lyžařských areálů Smrčina a Špičák předloží MMR k rozhodnutí Vládě ČR. Termín rozhodnutí vlády nelze předjímat.

Poté, co budou vyřešeny rozpory vládou ČR, bude návrh ZUR upraven na podkladě výsledků řešení rozporů. Současně bude MMR požádáno o vydání stanoviska podle § 38 stavebního zákona. Veřejné projednání návrhu ZUR bude zahájeno neprodleně po vydání stanoviska MMR. Po veřejném projednání bude následovat konečná úprava návrhu ZUR a jeho vydání ZUR v zastupitelstvu kraje. Termín vydání ZÚR nelze v současné době předjímat – tento termín je přímo závislý na datu vyřešení výše uvedených rozporů.